Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TapbpQ9R233 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TapbpQ9R233 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms