Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Psma1Q9R1P4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms