Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lamc3Q9R0B6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamc3Q9R0B6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms