Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Gpc6Q9R087 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc6Q9R087 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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