Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp21Q9QZL6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp21Q9QZL6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms