Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ercc4Q9QZD4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms