Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubxn8Q9QZ49 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms