Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnnt3Q9QZ47 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnnt3Q9QZ47 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms