Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phtf1Q9QZ09 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phtf1Q9QZ09 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms