Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr2e3Q9QXZ7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms