Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limd1Q9QXD8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms