Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chaf1aQ9QWF0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chaf1aQ9QWF0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms