Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdcQ9QW08 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdcQ9QW08 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdcQ9QW08 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PdcQ9QW08 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdcQ9QW08 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PdcQ9QW08 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdcQ9QW08 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdcQ9QW08 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdcQ9QW08 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdcQ9QW08 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdcQ9QW08 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdcQ9QW08 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdcQ9QW08 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdcQ9QW08 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PdcQ9QW08 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms