Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1eQ9JMK2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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