Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc2lQ9JME7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms