Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SrfQ9JM73 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrfQ9JM73 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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