Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Higd1aQ9JLR9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Higd1aQ9JLR9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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