Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtsmQ9JL96 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms