Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gde1Q9JL56 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gde1Q9JL56 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms