Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgn5Q9JL35 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgn5Q9JL35 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgn5Q9JL35 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgn5Q9JL35 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgn5Q9JL35 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgn5Q9JL35 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgn5Q9JL35 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgn5Q9JL35 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgn5Q9JL35 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgn5Q9JL35 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgn5Q9JL35 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgn5Q9JL35 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgn5Q9JL35 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgn5Q9JL35 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgn5Q9JL35 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgn5Q9JL35 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgn5Q9JL35 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgn5Q9JL35 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Hmgn5Q9JL35 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Hmgn5Q9JL35 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Hmgn5Q9JL35 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmgn5Q9JL35 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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