Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb3Q9JKS4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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