Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Scamp5Q9JKD3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scamp5Q9JKD3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms