Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmbr1Q9JIT0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms