Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clstn2Q9ER65 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms