Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r46Q9EQ45 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r46Q9EQ45 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms