Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPE9

Atp13a1, Manganese-transporting ATPase 13A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a1Q9EPE9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp13a1Q9EPE9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms