Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Xab2Q9DCD2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms