Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmg20aQ9DC33 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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