Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Foxp4Q9DBY0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms