Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med27Q9DB40 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med27Q9DB40 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med27Q9DB40 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med27Q9DB40 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med27Q9DB40 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med27Q9DB40 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med27Q9DB40 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med27Q9DB40 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med27Q9DB40 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med27Q9DB40 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med27Q9DB40 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Med27Q9DB40 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Med27Q9DB40 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms