Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc89Q9DA73 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms