Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D9D9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D9D9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D9D9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Q9D9D9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D9D9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms