Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms