Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn9Q9D805 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms