Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Capns2Q9D7J7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Capns2Q9D7J7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Capns2Q9D7J7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Capns2Q9D7J7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Capns2Q9D7J7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Capns2Q9D7J7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Capns2Q9D7J7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Capns2Q9D7J7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Capns2Q9D7J7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Capns2Q9D7J7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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