Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D7E4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D7E4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9D7E4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9D7E4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9D7E4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9D7E4 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9D7E4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9D7E4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms