Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf225Q9D7D1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms