Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q9D727 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q9D727 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Q9D727 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q9D727 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms