Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Borcs6Q9D6W8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Borcs6Q9D6W8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms