Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc94Q9D6J3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms