Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms