Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc130Q9D516 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms