Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms