Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx29Q9D3S3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms