Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms