Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snx20Q9D2Y5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snx20Q9D2Y5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms