Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Trappc6bQ9D289 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Trappc6bQ9D289 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Trappc6bQ9D289 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Trappc6bQ9D289 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Trappc6bQ9D289 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Trappc6bQ9D289 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Trappc6bQ9D289 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc6bQ9D289 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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