Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chordc1Q9D1P4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chordc1Q9D1P4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms