Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hddc3Q9D114 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms