Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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Zbed3Q9D0L1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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